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Genetic diversity of taro, Colocasia esculenta (L.) Schott, in Southeast Asia and the Pacific

Kreike C.M., Van Eck H.J., Lebot Vincent. 2004. Theoretical and Applied Genetics.
ARTICLE, (2004 ) - PUBLISHEDVERSION - English (en-GB)
Theoretical and Applied Genetics
RESTRICTEDACCESS - Cirad license, info:eu-repo/semantics/restrictedAccess, https://agritrop.cirad.fr/mention_legale.html.
Audience : RESEARCHERS, STUDENTS
Springer
Subject
F30 - Génétique et amélioration des plantes, Colocasia esculenta, polyploïdie, technique analytique, variation génétique, http://aims.fao.org/aos/agrovoc/c_1765, http://aims.fao.org/aos/agrovoc/c_6094, http://aims.fao.org/aos/agrovoc/c_1513, http://aims.fao.org/aos/agrovoc/c_15975, http://aims.fao.org/aos/agrovoc/c_7260, http://aims.fao.org/aos/agrovoc/c_7264
Domains
Agriculture, Biologie, Sciences du vivant, Agronomie
Description

[EN] The genetic diversity of 255 taro (Colocasia esculenta) accessions from Vietnam, Thailand, Malaysia, Indonesia, the Philippines, Papua New Guinea and Vanuatu was studied using AFLPs. Three AFLP primer combinations generated a total of 465 scorable amplification products. The 255 accessions were grouped according to their country of origin, to their ploidy level (diploid or triploid) and to their habitat cultivated or wild. Gene diversity within these groups and the genetic distance between these groups were computed. Dendrograms were constructed using UPGMA cluster analysis. In each country, the gene diversity within the groups of wild genotypes was the highest compared to the diploid and triploid cultivars groups. The highest gene diversity was observed for the wild group from Thailand (0.19), the lowest for the diploid cultivars group from Thailand (0.007). In Malaysia there was hardly any difference between the gene diversity of the cultivars and wild groups, 0.07 and 0.08, respectively. The genetic distances between the diploid cultivars groups ranges from 0.02 to 0.10, with the distance between the diploid accessions from Thailand and Malaysia being the highest. The genetic distances between the wild groups range from 0.05 to 0.07. First, a dendrogram was constructed with only the diploids cultivars from all countries. The accessions formed clusters largely according to the country from which they originated. Two major groups of clusters were revealed, one group assembling accessions from Asian countries and the other assembling accessions from the Pacific. Surprisingly, the group of diploid cultivars from Thailand clustered among the Pacific countries. Secondly, a dendrogram was constructed with diploid cultivated, triploid cultivated and wild accessions. Again the division of the accessions into an Asian and a Pacific gene pool is obvious. The presence of two gene pools for cultivated diploid taro has major implications for the breeding and conservation of germplasm.


[FR] La diversité génétique de 255 accessions de taro (Colocasia esculenta) provenant du Vietnam, de Thaïlande, de Malaisie, d'Indonésie, des Philippines, de Papouasie-Nouvelle-Guinée et de Vanuatu a été étudiée à l'aide de la technique AFLP. Trois combinaisons d'amorces AFLP ont généré un total de 465 produits d'amplification pouvant être évalués. Les 255 accessions ont été regroupées en fonction de leur pays d'origine, de leur niveau de ploïdie (diploïde ou triploïde) et de leur habitat (cultivé ou sauvage). La diversité génétique au sein de ces groupes et la distance génétique entre ces groupes ont été calculées. Des dendrogrammes ont été construits à l'aide d'une analyse de regroupement UPGMA. Dans chaque pays, la diversité génétique au sein des groupes de génotypes sauvages était la plus élevée par rapport aux groupes de cultivars diploïdes et triploïdes. La diversité génétique la plus élevée a été observée pour le groupe sauvage de Thaïlande (0,19), la plus faible pour le groupe des cultivars diploïdes de Thaïlande (0,007). En Malaisie, il n'y avait pratiquement aucune différence entre la diversité génétique des cultivars et celle des groupes sauvages, respectivement 0,07 et 0,08. Les distances génétiques entre les groupes de cultivars diploïdes varient de 0,02 à 0,10, la distance entre les accessions diploïdes de Thaïlande et de Malaisie étant la plus élevée. Les distances génétiques entre les groupes sauvages varient de 0,05 à 0,07. Tout d'abord, un dendrogramme a été construit avec uniquement les cultivars diploïdes de tous les pays. Les accessions ont formé des clusters en grande partie en fonction du pays d'origine. Deux grands groupes de grappes ont été mis en évidence, l'un regroupant les accessions des pays asiatiques et l'autre celles du Pacifique. Étonnamment, le groupe des cultivars diploïdes de Thaïlande s'est regroupé avec les pays du Pacifique. Ensuite, un dendrogramme a été construit à partir des accessions diploïdes cultivées, triploïdes cultivées et sauvages. Là encore, la division des accessions en un pool génétique asiatique et un pool génétique pacifique est évidente. La présence de deux pools génétiques pour le taro diploïde cultivé a des implications majeures pour la sélection et la conservation du matériel génétique.


 

Keywords
Language
English (en-GB)
Creators
Kreike, C.M., Van Eck, H.J., Lebot, Vincent
Contributors
Sources
Theoretical and Applied Genetics, 109 (4) : pp. 761-768
Relation
http://agritrop.cirad.fr/522926/
https://doi.org/10.1007/s00122-004-1691-z
10.1007/s00122-004-1691-z
info:eu-repo/semantics/altIdentifier/doi/10.1007/s00122-004-1691-z
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Coverage
Vanuatu
Name of newspaper
Theoretical and Applied Genetics