Subject
[SDV.BV.PEP]Life Sciences [q-bio]/Vegetal Biology/Phytopathology and phytopharmacy, [SDV.BBM]Life Sciences [q-bio]/Biochemistry, Molecular Biology

Domains
Biologie, Sciences du vivant

Description

International audience Cordyline virus 1 (CoV1) is a velarivirus that has so far only been reported in ornamental Ti plants (Cordyline fruticosa). Using high-throughput sequencing, we identified CoV1 infection in yam accessions from Vanuatu. Using a specific RT-PCR assay, we found that CoV1 is also present and highly prevalent in Dioscorea alata, D. cayenensis, and D. trifida in Guadeloupe. Phylogenetic analysis showed that CoV1 isolates infecting yam in Guadeloupe display a low level of molecular diversity. These data provide insights into the transmission of CoV1 in yam in Guadeloupe.

Keywords

Language
English (en-GB)

Creators
Diouf, Mame Boucar, Gaspard, Olyvia, Marais-Colombel, Armelle, Filloux, Denis, Gomez, Rose-Marie, Faure, Chantal, Roumagnac, Philippe, Candresse, Thierry, , Theil, Sébastien, Contreras, Sandy, Teycheney, Pierre-Yves, Umber, Marie

Contributors
Agrosystèmes tropicaux (ASTRO) ; Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE), Amélioration génétique et adaptation des plantes méditerranéennes et tropicales (UMR AGAP) ; Centre de Coopération Internationale en Recherche Agronomique pour le Développement (Cirad)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-Institut Agro Montpellier ; Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro)-Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro), Biologie du fruit et pathologie (BFP) ; Université de Bordeaux (UB)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE), Plant Health Institute of Montpellier (UMR PHIM) ; Centre de Coopération Internationale en Recherche Agronomique pour le Développement (Cirad)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE)-Institut Agro Montpellier ; Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro)-Institut national d'enseignement supérieur pour l'agriculture, l'alimentation et l'environnement (Institut Agro)-Université de Montpellier (UM), Peuplements végétaux et bioagresseurs en milieu tropical (UMR PVBMT) ; Centre de Coopération Internationale en Recherche Agronomique pour le Développement (Cirad)-Institut de Recherche pour le Développement (IRD)-Université de La Réunion (UR)-Institut National de Recherche pour l’Agriculture, l’Alimentation et l’Environnement (INRAE), Guadeloupe Region through the Malin project (2018-FED-1088) under the EU's Seventh Framework Programme., ANR-11-EBIM-0002,SafePGR,Amélioration du diagnostic viral pour sécuriser les ressources génétiques végétales(2011)

Sources
ISSN: 0304-8608, EISSN: 1432-8798, Archives of Virology, https://hal.inrae.fr/hal-03747703, Archives of Virology, Springer Verlag, In press, ⟨10.1007/s00705-022-05535-2⟩

Relation
info:eu-repo/semantics/altIdentifier/doi/10.1007/s00705-022-05535-2

Coverage
Vanuatu

Name of newspaper