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Phenotypic characterization of sweet potato Ipomoea batatas (L.) Lam. genotypes in relation to prediction of chemical quality constituents by NIRS equations

Lebot Vincent, Malapa Roger, Ndiaye André. 2011. Plant Breeding.
Phenotypic characterization of sweet potato Ipomoea batatas (L.) Lam. genotypes in relation to prediction of chemical quality constituents by NIRS equations
ARTICLE, (2011 ) - PUBLISHEDVERSION - English (en-GB)
Plant Breeding
OPENACCESS - Cirad license, info:eu-repo/semantics/restrictedAccess, https://agritrop.cirad.fr/mention_legale.html.
Audience : OTHER, RESEARCHERS
Blackwell Verlag GmbH
Sujet
F30 - Génétique et amélioration des plantes, Q04 - Composition des produits alimentaires, U40 - Méthodes de relevé, F60 - Physiologie et biochimie végétales, F50 - Anatomie et morphologie des plantes
Domaines
Agriculture, Biologie, Sciences du vivant, Sciences exactes, Chimie, Agronomie
Description
[EN] This study evaluates the potential of NIRS (near-infrared reflectance spectroscopy) to predict the major constituents (starch, sugars, cellulose, proteins and minerals) of the sweet potato root. Overall, 240 accessions were morphologically described, chemically analysed and their NIR spectra recorded. No correlations were observed between aerial and underground traits, and between morphological traits and major constituents. Calibration equations, developed on 190 accessions, showed high explained variances in cross-validation (r2cv) for starch (0.82), sugars (0.91), proteins (0.89) and minerals (0.74) but no response for cellulose (0.21). The predictions were tested on an independent set of 50 randomly selected accessions. The r2pred values for starch, sugars and proteins were, respectively, of 0.71, 0.82 and 0.87 with ratios of performance to deviation (RPD) of 2.11, 2.29 and 2.93. New calibration equations developed on 240 accessions showed improved RPD values for starch (2.65), sugars (2.75), cellulose (1.58), proteins (3.47) and minerals (2.34), indicating that larger sets could improve prediction. NIRS could be used in sweet potato breeding programmes to predict starch, sugars and proteins contents in the roots. (Résumé d'auteur)
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[FR] Cette étude évalue le potentiel de la spectroscopie de réflectance dans le proche infrarouge (NIRS) pour prédire les principaux constituants (amidon, sucres, cellulose, protéines et minéraux) de la racine de patate douce. Au total, 240 accessions ont fait l’objet d’une description morphologique, d’une analyse chimique et d’un enregistrement de leurs spectres NIR. Aucune corrélation n’a été observée entre les caractères aériens et souterrains, ni entre les caractères morphologiques et les principaux constituants. Les équations d’étalonnage, élaborées à partir de 190 accessions, ont montré des variances expliquées élevées lors de la validation croisée (r²cv) pour l’amidon (0,82), les sucres (0,91), les protéines (0,89) et les minéraux (0,74), mais aucune réponse pour la cellulose (0,21). Les prédictions ont été testées sur un ensemble indépendant de 50 accessions sélectionnées au hasard. Les valeurs de r2pred pour l’amidon, les sucres et les protéines étaient respectivement de 0,71, 0,82 et 0,87, avec des rapports performance/écart (RPD) de 2,11, 2,29 et 2,93. De nouvelles équations d’étalonnage élaborées à partir de 240 accessions ont montré des valeurs de RPD améliorées pour l’amidon (2,65), les sucres (2,75), la cellulose (1,58), les protéines (3,47) et les minéraux (2,34), ce qui indique que des ensembles plus importants pourraient améliorer la prédiction. La spectroscopie NIRS pourrait être utilisée dans les programmes de sélection de la patate douce pour prédire les teneurs en amidon, en sucres et en protéines des racines.
Mots-clés
Ipomoea batatas, Igname, Qualité, Composition chimique, Génotype, Technique de prévision, Spectroscopie infrarouge, Teneur en glucides, Teneur en éléments minéraux, Teneur en protéines, Amidon
Langue
English (en-GB)
Auteurs
Lebot Vincent, Malapa Roger, Ndiaye André
Contributeurs
Sources
Plant Breeding 130, 457—463 (2011), doi:10.1111/j.1439-0523.2010.01840.x
Couverture
Vanuatu
Nom du journal
Plant Breeding